История профессионального мини-футбольного клуба «Северная Двина» началась в сентябре 2018 года. По инициативе президента областной федерации футбола совместно с губернатором Архангельской области и руководителем областного агентства по спорту было принято решение о создании клуба. Инициативу полностью поддержала Ассоциация мини-футбола России.

Датой создания команды считается 17 марта 2019 года: клуб официально приступил к формированию своей структуры. Основной курс в поиске игроков был направлен на местных спортсменов. Тренером стал Дмитрий Чугунов - титулованный наставник с большой карьерой и богатым списком достижений. Первый матч команда провела на Первенстве России по мини-футболу среди команд Первой лиги (дивизион «Северо-запад»). Обстоятельства не помешали «Северной Двине» победить в дебютном турнире.

В апреле 2019 года «Норд Арена», домашняя площадка команды, приняла Финал Всероссийских соревнований по мини-футболу среди любительских команд Первой Лиги, который стал для «Северной Двины» серьезным испытанием и хорошим опытом, хоть и при отрицательном результате. 10 апреля было подписано соглашение с ООО «ТГК-2 Энергосбыт» как с титульным спонсором команды. 18 мая был подписан первый профессиональный контракт с архангельским футболистом Даниилом Анциферовым, а 13 июня по распоряжению совета клуба генеральным директором был официально назначен Глеб Орлов.

В межсезонье руководство команды заявилось на Первенство России по мини-футболу среди команд Высшей лиги конференция «запад». К сезону 2019 – 2020 гг. клуб провел селекционную работу, итогом которой стало подписание контрактов с 15 игроками, 13 из которых – представители местного футбола. 7 сентября 2019 года на паркете домашнего зала «Норд Арена» она провела свой дебютный матч в Первенстве России Париматч – Высшая лига конференция «запад».

Из-за пандемии коронавируса турнир был завершен досрочно, «Северная Двина» к этому моменту занимала одиннадцатую строчку в турнирной таблице.

Мини-футбольный клуб «Северная Двина» имеет дублирующий состав, который выступает в самом престижном юношеском мини-футбольном турнире России «Спортмастер - Юниорлига U-18». В сезоне 2019/20 второй и четвертый туры Юниорлиги прошли на домашней арене «Северной Двины» - в ЦРС «Норд Арена». Подопечные Сергея Бажукова и Кирилла Кучкина заняли 10 место, до зоны плей-офф им не хватило одной победы. Также дубль «Двины» принимает участие в «Суперлиге» Чемпионата Архангельска.

Во второй сезон клуб вошел с новой эмблемой и слоганом К НОВЫМ БЕРЕГАМ! Динамику логотипа создаёт стремительное движение волн вверх с летящим на них футбольным мячом, стилизованным под наш главный талисман клуба - морошку.

5 сентября МФК «Северная Двина» начала выступления во втором для себя сезоне Первенства России по мини-футболу Париматч - Высшая лига. 

Добавим, что ближайшая выездная игра 21 тура Париматч – Высшей лиги против клуба «Ростов» пройдёт с болельщиками 21 февраля в городе Ростове-на-Дону. Поддержите земляков!