По информации издания сводная сестра Ильи Михальчука Софья Наймушина родилась в Семипалатинске Казахской ССР. Закончила в 1987 году Магаданский филиал Всесоюзного юридического заочного института, а в 1999 году – аспирантуру в Российской академии государственной службы при президенте РФ.
С 1993 года работала в системе Министерства юстиции Республики Саха – Якутия ведущим специалистом по вопросам нотариата. С 1994 по 2004 год – президент Нотариальной палаты Республики Саха – Якутия. С 1999 года – член правления Федеральной нотариальной палаты. В 2004–2005 годах работала и.о. руководителя Федеральной регистрационной службы по Республике Саха – Якутия. С декабря 2007 года возглавляет Федеральную регистрационную службу по Мурманской области.
Сестра Архангельского губернатора является советником государственной гражданской службы Российской Федерации 2 класса. Она кандидат юридических наук, к тому же является автором монографии «Конституционно-правовые основы регулирования местного самоуправления».
Супруга Ильи Михальчука - Жанетта Арнольдовна родилась 22 февраля 1957 года в Даугавпилсе Латвийской ССР. Девичья фамилия – Бейнар.
В 2007 году оказалась в центре крупного скандала: Жанетта Михальчук получила в «Сахадаймондбанке» 4 млн. рублей кредита на покупку новой квартиры, однако кредит, полученный Михальчук, погашал Единый расчетно-кассовый центр Якутска за счет платежей населения. Когда история стала известна, Жанетта Михальчук самостоятельно погасила кредит, это помогло ей избежать уголовной ответственности.
Она является совладельцем якутского ООО «Прогресс» (выручка в 2007 г. – 40,9 млн руб., чистая прибыль – 7,2 млн руб., в апреле 2009 г. введена процедура наблюдения) и ООО «Сайдыы» (выручка в 2002 г. – 25,3 млн руб.). Жанетта Михальчук возглавляет попечительский совет детской областной клинической больницы в Архангельске.
Старший сын Ильи Филипповича Александр родился в 1980 году. Он учился в Саха-турецком колледже в Якутске, в 10–11 классах – в частной школе в Швейцарии. Закончил Бостонский университет по специальности «менеджмент». Вернувшись в Россию, решил получить второе высшее образование в Академии труда и социальных отношений по специальности «финансы и кредит».
Параллельно с обучением работал в московском офисе компании «Юкос». По данным СПАРК, Александр Михальчук является совладельцем якутского ООО «Северный ветер».
С 2008 года – первый заместитель руководителя исполкома Архангельского регионального отделения партии «Единая Россия», заместитель секретаря рабочей группы по технологическому обеспечению избирательных кампаний. В 2010 году Александр стал руководителем партийного проекта «Управдом», в рамках которого будет проходить обучение менеджеров, управляющих жилыми домами.
В августе 2005 года его супругой стала дочь казахского нефтяника Динара, с которой он познакомился во время обучения в США. По словам Ильи Михальчука, свадьба обошлась в 3,5 млн. руб. Медовый месяц молодожены провели в Китае. 6 декабря 2006 года у Александра и Динары родилась дочь. Фамилии отца Динары установить не удалось.
Младшему сыну губернатора Дмитрию 26 лет. Он родился в Якутске. Окончил частную школу в Швейцарии. Учился в Бостонском университете.
